Для распознавания нотного текста использую 2 программы - "PDFtoMusic Pro" и "SmartScore X2 Pro". Обе есть и под винду, и под мак.
SmartScore X2 Pro более всеядная в плане считывания разных файлов, в ней есть и мало-мальский редактор. Эта программа больше подойдёт для тех, кто работает в Finale. PDFtoMusic Pro читает исключительно те .pdf'ки, которые были созданы напрямую (путём конвертирования или печати виртуальным принтером) из нотных редакторов (Finale, Sibelius, Notion), т.е. считывает ocr-слой. В зависимости от исходного файла пользуюсь либо той, либо другой программой, конвертирую исключительно в musicXML с последующим открытием в Sibelius'е или Final'е. Но, к сожалению, зачастую результат далеко не всегда совпадает с желаемым.
Пытался пользоваться PhotoScore и SharpEye, но как-то не впечатлился (а может и не разобрался).
Есть ещё "NotateMe" для Android, "Music Scanner" и "Сканер нот" для iPad, но эти программы не рассматриваю всерьёз.